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生物医学转化平台介绍

 

在精准医疗和大数据医学时代来临的背景下,生物医学部基于临床医院以及检测行业的特定需求,开展了生物检测技术研发平台拓展建设,完成了一系列方法体系建设以及特定检测方法的研发,提升了产研院生物医学部科研创新服务能力,推进成果转化应用。

(1)搭建了基于Thermo Q-Exactive四极杆-静电场轨道阱高分辨串联质谱系统(图1)的3套组合,包括nano-LC-MS系统,UHPLC-UV系统和UHPLC-MS系统,可分别应用于蛋白质组学,蛋白质组学样品离线多维分离,以及代谢组学(包含脂质组学)。提供以蛋白质组学、代谢组学(脂质组学)为代表的多组学实验体系、数据分析体系及相应的科研服务。


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图1. Thermo Q-Exactive四极杆-静电场轨道阱高分辨串联质谱系统

(2)针对上海市儿童医院高苯丙氨酸血症分型诊断需求,开展了“儿童遗传代谢病质谱筛查技术转化应用能力建设”项目,建立了基于质谱技术的尿样蝶呤分析方法和血片蝶呤分析方法;形成了完整的可推广的高苯丙氨酸血症分型诊断技术体系;建立了可用于遗传代谢病领域的代谢组学技术体系;开发了用于高苯丙氨酸血症分型诊断的试剂盒。该技术平台作为产研院的开放式创新平台,可为遗传代谢病相关医院和专业机构提供检测服务、科研服务以及协同创新空间。

(3)针对检测行业普遍存在的致病微生物快速、便捷、准确、低成本检测的需求,在“食源性致病菌广谱高效检测系统的开发及应用”(上海市企业自主创新专项-产学研合作计划,沪CXY-2013-58)、“新型核酸扩增反应检测技术研发能力建设”(产研院创新功能型平台建设项目,SKY2015003)等项目支持下,运用元基因组学研究策略、比较基因组学技术、生物信息学技术以及等温扩增检测方法,开发完成了一系列关键技术,建立了基于核酸扩增技术的新型检测体系,储备了一批具有应用价值的研究成果(图2)。目前已申请中国发明专利16项。先后与上海旺旺食品集团有限公司、上海一只鼎食品有限公司和亿菩升(上海)生物科技有限公司等机构建立了创新合作伙伴关系,通过开展产业共性技术研发,解决产业链缺失环节、关键环节上的技术需求,提升传统产业升级(图3);通过新型产业技术的研发和服务,发展战略性新型产业,进一步落实上海“创新驱动、转型发展”战略。本项目成果目前正在向食品生产行业、生物安全检测行业进行推广。


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图2. 基于等温扩增技术的致病微生物检测体系


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图3. 旺旺集团技术人员在产研院接受技术培训