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贾佳博士介绍(CO-PI)

 

jiajai课题组长:贾佳,博士。1997~2001年就读于浙江大学,获学士学位。2001~2003年工作于杭州华大基因研究发展中心。2003~2006年就读 于浙江大学沃森基因组研究院,获硕士学位。2006~2011年,赴新加坡国立大学攻读博士。2011.4~目前,就职于上海生物信息技术研究中心,生命科学数据中心负责人,副研究员。2013年获上海市“浦江人才”资助。

【主要研究方向】
(1)生物医药信息数据资源开发和整合技术的研究:建立面向生物医学数据、生物医学文献、临床样本库相关的数据挖掘、数据整合、数据展示技术、平台和软件开发,为形成稳定的开放式综合公共服务体系提供技术支持和服务;⑵网络药理学相关研究:通过药物和疾病网络角度研究肿瘤耐药和联合用药机制,利用功能基因组和生物信息技术探讨患者药物反应的个体差异,从而指导临床用药。目前作为主要负责人承担和参与国家863、国家自然科学基金、上海市研发公共服务平台建设专项课题、上海市浦江人才等多项国家和地方科研项目。近五年来在《Nature Reviews Drug Discovery》等国内外专业刊物上发表学术论文20余篇。

【代表文章】
1. J. Li*, J. Jia*, H. Li2, J. Yu, H. Sun, Y. He, D.Q. Lv, X.J. Yang, M.O. Glocke, L.X. Ma, J.B. Yang, L. Li, W. Li, G.Q.Zhang, Q. Liu, Y.X. Li, L. Xie. SysPTM 2.0: an updated systematic resource for post-translational modification. (Database 2014, accepted, IF=4.200)2. J.X. Zhang*, J. Jia*, F. Zhu, X.H. Ma, B.C. Han, X.N. Wei, C.Y. Tan, Y.Y. Jiang and Y.Z. Chen. Analysis of bypass signaling in EGFR pathway and profiling of bypass genes for predicting response to anticancer EGFR tyrosine kinase inhibitors. Mol. BioSyst. 8(10):2645-56, 2012 (共同第一作者, IF=3.859 引用次数=1)3. Y.Q Ge, R.B Cheng, Q. Dai, P. Liu, H.B Wang, X.Q Ma, J. Jia*, Z. Chen*, Cryptotanshinone induces cell cycle arrest and apoptosis of human myeloid leukemia cells by inhibiting the activity of eukaryotic Initiation Factor 4E, Mol. Cell. Biochem. 368(1-2):17-25, 2012 (共同通讯作者,IF=2.057 引用次数=5)
4. J. Jia, F. Zhu, X.H. Ma, Z.W. Cao, Y.X. Li and Y.Z. Chen. Mechanisms of drug combinations from interaction and network perspectives. Nat. Rev. Drug Discov., 8(2):111-28(2009). (IF= 29.008
引用次数=159)
5. J. Jia, Cui. J. , X. H. Liu, J. H. Han, S. Y. Yang, Y. Q. Wei, and Y. Z. Chen. Genome-Scale Search of Tumor-Specific Antigens by Collective Analysis of Mutations, Expressions and T-Cell Recognition. Mol. Immunol., 46:1824-1829(2009). (IF= 2.897
引用次数=3)
6. L. Zheng, J. Jia, Z.G. Guo, L. Finger, C. Zer, B.H. Shen, Functional regulation of FEN1 nuclease and its link to cancer. Nucleic Acids Res., 39:1-14(2010). (IF= 8.026
,引用次数=42)

7. J. Jia, L. Yang, Z. Zhang. EHPred: an SVM-based method for epoxide hydrolases recognition and classification. J Zhejiang Univ Sci B., 7(1): 1-6(2006). (IF=1.679, 引用次数= 4)


【代表性会议】

2013724日,美洲华人生物科学学会“DNA修复及修饰基因组会议,邀请报告:SysPTM: a systematic resource for proteomic research on post-translational modifications
2012
9月中德系统生物学及系统病理学会议,邀请报告:Profiling of bypass genes for predicting response to anticancer EGFR tyrosine kinase inhibitors
2009
9月日本科学促进协会(JSPS) HOPE会议,获优秀展板奖、团体报告金奖
2008
4月第三届东亚生物信息网络会议,邀请报告:Predicting Receptor Targets of Traditional Chinese Medicines and Small Molecule TCM Databas